周建宇
所属部门: 软件工程系
电子邮件: jyzhou@nankai.edu.cn
职 称: 讲师
学 历: 博士研究生
所学专业: 计算机科学与技术
研究方向: 组合优化、贝叶斯统计、计算生物学
教育经历
2015年9月-2020年10月 清华大学，计算机科学与技术系，工学博士，导师：Tao Jiang
2011年9月-2015年6月 大连理工大学，yl6776永利集团，工学学士
工作经历
2020年10月至今，yl6776永利集团，讲师
2019年1月-2019年7月，University of California, Riverside，访问学者
2014年5月-2014年11月，微软亚洲研究院，研究实习生
科研项目
1. 主持国家自然科学基金青年项目《基于广义后缀自动机的序列对图比对算法》，2023/01-2025/12
2. 主持高校基本科研基金青年教师启动项目《基于三代测序的转录组免比对拼接算法》，2021/01-2021/12
3. 参与国家重点研发计划《智能计算软件平台优化与应用》，2021/12-2023/11
论文情况
[1] Zhou, J., Ma, S., Wang, D., Zeng, J., & Jiang, T.* (2018). FreePSI: an alignment-free approach to estimating exon-inclusion ratios without a reference transcriptome. Nucleic acids research, 46(2), e11-e11.
[2] Zhou, J., Li, P., Zeng, W., Ma, W., Lu, Z., Jiang, R., Zhang, Q.*, & Jiang, T.* (2020). IRIS: a method for predicting in vivo RNA secondary structures using PARIS data. Quantitative Biology, 8(4), 369-381.
[3] Xiang, Y., Gu, J., & Zhou, J.* (2023). EdtClust: A fast homologous protein sequences clustering method based on edit distance. In 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) (pp. 690-697). IEEE.
[4] Wang, X., Zhang, J., & Zhou, J.* (2023). Diffusion-Enhanced Graph Attention Network for Cancer Type Classification. In 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) (pp. 299-305). IEEE.
[5] Cui, H., Qi, H., & Zhou, J.* (2024). DBN-MACTraj: Dynamic Bayesian Networks for Predicting Combinations of Long-Term Trajectories with Likelihood for Multiple Agents. Mathematics, 12(23), 3674.
[6] Song, R., Wang, X., Zhang, J., Chen, S.*, & Zhou, J.* (2024). GATDE: A graph attention network with diffusion-enhanced protein-protein interaction for cancer classification. Methods, 231, 70-77.
[7] Hua, H., Long, W., Pan, Y., Li, S., Zhou, J.*, Wang, H.*, & Chen, S*. (2024). scCrab: A Reference-Guided Cancer Cell Identification Method based on Bayesian Neural Networks. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 1-15.
[8] Wang, Y., Yu, H., Sun, F., & Zhou, J.* (2024) CFMT: A Music Transcription Model using Conformer Architecture. In Proceedings of the International Conference on Intelligent Computing (ICIC 2024). Poster Volume Ⅱ, 412-427.
[9] Cui, H., & Zhou, J.* (2023). A Probabilistic Model for Long-Term Trajectory Prediction in Multi-Agent Systems. In 2023 IEEE 8th International Conference on Intelligent Transportation Engineering (ICITE) (pp. 202-208). IEEE.
[10] Li, C., Xie, W., Rosenblum, J. S., Zhou, J., Guo, J., Miao, Y., Shen, Y., Wang, H., Gong, L., Li, M., Zhao, S., Cheng, S., Zhu, H., Jiang, T., Ling, S., Wang, F., Zhang, H., Zhang, M., Qu, Y., Zhang, Q., Li, G., Wang, J., Ma, J., Zhuang, Z., & Zhang, Y.* (2020). Somatic SF3B1 hotspot mutation in prolactinomas. Nature communications, 11(1), 2506.
[11] Li, P., Wei, Y., Mei, M., Tang, L., Sun, L., Huang, W., Zhou, J., Zou, C., Zhang, S., Qin, C., Jiang, T., Dai, J., Tan, X., & Zhang, Q.* (2018). Integrative analysis of Zika virus genome RNA structure reveals critical determinants of viral infectivity. Cell host & microbe, 24(6), 875-886.
[12] Xu, C., Liu, Q., Zhou, J., Xie, M., Feng, J., & Jiang, T.* (2020). Quantifying functional impact of non-coding variants with multi-task Bayesian neural network. Bioinformatics, 36(5), 1397-1404.
[13] Xu, X., Zhou, J., Liu, Y., Xu, Z., & Zhao, X.* (2014). Taxi-RS: Taxi-hunting recommendation system based on taxi GPS data. IEEE Transactions on Intelligent Transportation Systems, 16(4), 1716-1727.
[14] Wu, J., He, Z., Gu, F., Liu, X., Zhou, J.*, & Yang, C. (2016). Computing exact permutation p-values for association rules. Information Sciences, 346, 146-162.
讲授课程
研究生课程：
《计算机算法设计》2021年至2024年秋季
《软件过程管理》2021年至2022年秋季
《研究生编程实训》2023年至2024年夏季
本科课程：
《概率论与数理统计》2025年春季
《计算机组成原理》2021年至2025年春季
《算法导论》2024年春季
《软件过程管理》2021年春季
获奖情况
2025年《计算机算法设计》课程获永利官网优秀研究生课程
2024年获永利官网优秀班导师称号
2023年指导员工论文获ICITE2023会议最佳论文奖
2022年获教育部计算机系统课程虚拟教研室突出贡献奖
社会兼职
中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员
教育部计算机系统课程虚拟教研室成员
《Frontiers in Plants》专刊副编辑
培养员工
崔浩楠（去向：大疆算法工程师）
项溢馨（公能一等奖学金；去向：基因组所攻读博士）
王晓峰（国家奖学金；去向：航天四院工程师）
